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バージョンアップしましたが以前のバージョンとチェックサムが異なります。

チェックサムが変更になることは良くあります。
主にCコードの最適化(高速化を含み)とコード生成の汎用化(共通化)等が行われる様です。 一般的には*.lstファイルの新旧を比較する事で、どこのコード生成が異なっているかを見つける事ができます。